More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4180 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 459 aa  867    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  65.81 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  61.12 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  65.87 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  65.87 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  65.87 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  57.83 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  62.62 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  62.1 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  64.06 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  59.66 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 		 427 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  60.49 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  52.08 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  56.44 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  57.89 
 
 		 428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  59.86 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  51.93 
 
 		 420 aa  270  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  53.76 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  56.76 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  48.11 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  38.14 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  42.93 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  39.12 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  36.97 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  37.87 
 
 		 431 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.12 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  30 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.5 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.5 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 792 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 495 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.5 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.08 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.08 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.39 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 770 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 482 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.48 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.48 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  29.34 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.48 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 517 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.72 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.72 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.72 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.57 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 764 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  29.52 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.49 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.49 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.49 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 745 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.49 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.49 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.36 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.26 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  32.49 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 786 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.2 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 515 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>