More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4639 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 441 aa  807    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  57.24 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  61.39 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 		 423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  58.75 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  55.21 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  55.32 
 
 		 419 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  57.52 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  48.17 
 
 		 420 aa  269  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  57.66 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  57.62 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  56.16 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  47.99 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  51.88 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  51.08 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  50.53 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  37.27 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  36.3 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  46.49 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.81 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  36.84 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  35.21 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  32.42 
 
 		 489 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  39.59 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  69.91 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.38 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.38 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  29.38 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.38 
 
 		 471 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 491 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 496 aa  117  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.81 
 
 		 467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.81 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.24 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.53 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.47 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.26 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.32 
 
 		 542 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 538 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.57 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.76 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  30.97 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 549 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 465 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.14 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.14 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.93 
 
 		 525 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 563 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 515 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>