More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3674 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 549 aa  1093    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  55.81 
 
 		 563 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  54.42 
 
 		 561 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  49.64 
 
 		 542 aa  527  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  58.04 
 
 		 643 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  58.33 
 
 		 651 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  40.46 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  39.15 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 476 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  42.49 
 
 		 471 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  41.03 
 
 		 467 aa  359  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  42.2 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  42.2 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  40.07 
 
 		 494 aa  349  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.21 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  45.79 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  45.56 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  45.56 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  45.56 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  45.1 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  45.56 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  45.56 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  39.89 
 
 		 502 aa  346  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  39.93 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  37.55 
 
 		 471 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  38.46 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  41.2 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 		 466 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  38.46 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  45.56 
 
 		 467 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  44.99 
 
 		 495 aa  343  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  45.79 
 
 		 467 aa  343  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  39.45 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  39.45 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 		 486 aa  339  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  38.9 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  38.9 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  38.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  38.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  38.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  39.01 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  38.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  38.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  37.18 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  39.93 
 
 		 467 aa  336  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  39.56 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  40.5 
 
 		 475 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 465 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  37.18 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  39.12 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  36.01 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  35.78 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.57 
 
 		 466 aa  329  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  37.84 
 
 		 486 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  37.84 
 
 		 486 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  36.79 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  36.79 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  36.79 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  38.32 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  38.32 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 		 501 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  42.39 
 
 		 495 aa  326  7e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  38.49 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 469 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  45.11 
 
 		 517 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  37.48 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  39.3 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  37.1 
 
 		 489 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  37.37 
 
 		 482 aa  323  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  38.79 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  43.88 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  40.49 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 		 486 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 		 566 aa  317  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  36.43 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  35.34 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  36.08 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  35.9 
 
 		 471 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  35.61 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  44.11 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>