More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3470 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 561 aa  1116    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  72.06 
 
 		 563 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  54.07 
 
 		 549 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  58.93 
 
 		 643 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  59.67 
 
 		 651 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  50 
 
 		 542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 		 495 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  38.39 
 
 		 471 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  38.7 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  38.88 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  39.06 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  38.7 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  40.46 
 
 		 476 aa  351  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  37.92 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 		 471 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  36.41 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  38.06 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  38.06 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  37.88 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  37.7 
 
 		 471 aa  339  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  38.52 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  37.16 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  37.16 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  36.98 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  37.16 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  36.98 
 
 		 467 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  37.39 
 
 		 467 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  36.8 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  37.16 
 
 		 467 aa  330  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  38.15 
 
 		 468 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  37.16 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  37.46 
 
 		 465 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 438 aa  327  5e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  38.37 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  37.46 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  37.57 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  37.57 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  37.91 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  37.02 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  37.92 
 
 		 466 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  38.22 
 
 		 475 aa  320  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  37.14 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  36.25 
 
 		 467 aa  317  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  35.29 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  35.61 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  35.25 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  35.43 
 
 		 471 aa  316  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  35.25 
 
 		 471 aa  316  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  37.52 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  35.43 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  37.99 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  37.55 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  37.55 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  37.55 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  37.81 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  37.06 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  35.48 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  37.06 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  35.48 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  33.67 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  33.87 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  37.36 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  37.36 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  37.36 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  37.36 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  37.3 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  41.24 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 463 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  36.2 
 
 		 502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  34.33 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  37.66 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  34.57 
 
 		 503 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  37.41 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 		 513 aa  297  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  33.28 
 
 		 549 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  34.34 
 
 		 483 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>