More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2274 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 407 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  59.01 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  63.05 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  60.59 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  60.59 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  60.59 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  61.56 
 
 		 408 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  59.61 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  57.82 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  61.27 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  63.64 
 
 		 411 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  53.9 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  53.32 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  55.69 
 
 		 428 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  48.66 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  55.26 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 420 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  52.62 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  52.88 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  46.98 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  36.21 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  62.14 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  33.17 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  35.68 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  31.86 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.78 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  34.11 
 
 		 716 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  36.39 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 486 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 725 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.62 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.95 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.95 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.77 
 
 		 494 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.95 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.95 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.95 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  30.43 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.95 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  30.36 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  28.19 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  30.14 
 
 		 467 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 770 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.49 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 764 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  29.31 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.23 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.46 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.23 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 740 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.23 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 641 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.2 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.96 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.2 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.37 
 
 		 471 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 513 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 464 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.73 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.73 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.66 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 773 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  30.46 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 496 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 496 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 518 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  28.32 
 
 		 483 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 745 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.9 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.9 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>