More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1550 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 462 aa  919    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  57.69 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  57.47 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  57.47 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  57.24 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  59.04 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  54.95 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  55.26 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  56.72 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  57.67 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  54.28 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  56.25 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  54.28 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  56.25 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  56.08 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  56.25 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  54.65 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  54.65 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  46.59 
 
 		 441 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  45.47 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  47.72 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  45.25 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  46.12 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  45.06 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  42.83 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  43.05 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  44.12 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 		 450 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  46.22 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  43.48 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 461 aa  359  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  43.58 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  43.18 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  42.95 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  43.41 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  42.95 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  42.95 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  42.95 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  42.63 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  42.63 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  42.63 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  42.63 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  42.63 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  42.66 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  42.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  43.12 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  44.37 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  48.11 
 
 		 454 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  42.66 
 
 		 443 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  43.47 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  42.66 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  41.95 
 
 		 453 aa  346  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  41.84 
 
 		 453 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  42.73 
 
 		 463 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  42.5 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  40.37 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  42.18 
 
 		 443 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  41.11 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  36 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  35.76 
 
 		 443 aa  262  8e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  36.34 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  36.34 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  33.71 
 
 		 462 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  34.64 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  35.65 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  32.81 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 468 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  32.22 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  32.22 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  31.93 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  31.07 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  31.93 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  31.78 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>