More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0277 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 419 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  85.12 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  59.41 
 
 		 421 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  58.55 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  60.14 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  56.46 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  61.43 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  61.43 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  61.43 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  54.37 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  61.21 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  60.1 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  60.1 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  56.9 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  59.85 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  53.37 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  56.69 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  54.85 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  51.33 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  51.48 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37 
 
 		 441 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  37.12 
 
 		 433 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  35.88 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  36.85 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.38 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.97 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 641 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.45 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  29.83 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.82 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.71 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 792 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 764 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 770 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.49 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 820 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.43 
 
 		 525 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2013  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0847443  normal  0.208384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 539 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 745 aa  116  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.65 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.65 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.74 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 786 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.89 
 
 		 422 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 		 504 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.34 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.34 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.35 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.35 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.13 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.13 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.38 
 
 		 512 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 725 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.27 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 500 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  26.27 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 549 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 505 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.17 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.17 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>