More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  100 
 
 		 443 aa  823    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  48.6 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  52.2 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  50.23 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  52.71 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  50.83 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  50.83 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  50.83 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  53.86 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  47.41 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  51.57 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  49.77 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  48 
 
 		 427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  51.7 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  54.77 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  52.64 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  52.94 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  48.28 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  37.86 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  45.84 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  34.34 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  33.33 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  35.18 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  34.45 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  33.65 
 
 		 431 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  31.99 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 449 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 770 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.55 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 745 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 725 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 494 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 486 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.89 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.15 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.68 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.68 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 764 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.51 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 786 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.26 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  27.67 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  26.89 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 820 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2305  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  25.64 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 792 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  22.75 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.27 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  31.15 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.49 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.27 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.33 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.12 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.13 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  25.83 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>