More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4173 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 429 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  38.92 
 
 		 421 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  38.33 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  40.05 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  36.62 
 
 		 426 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  28.24 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 503 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  25.26 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.19 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  31.8 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.47 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  30.4 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.12 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.61 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.84 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.84 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.61 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.51 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.9 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.6 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.9 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.6 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.62 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.07 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.07 
 
 		 471 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.37 
 
 		 467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  30.43 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.09 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.09 
 
 		 753 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 515 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.9 
 
 		 476 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.62 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.2 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  29.72 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  29.72 
 
 		 525 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  31.48 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.38 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 518 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.83 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.08 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 770 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 473 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 521 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  26.94 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.3 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  28.34 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.05 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  29.08 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 504 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.23 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.23 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 792 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.53 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 786 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  27.07 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  28.25 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 482 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 482 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>