More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1945 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 423 aa  808    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  56.44 
 
 		 421 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  60.64 
 
 		 440 aa  349  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  58.5 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  58.91 
 
 		 419 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  51.42 
 
 		 427 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  57.32 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  55.37 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  48.92 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  58.59 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  56.57 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  50.94 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  51.1 
 
 		 420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  53.9 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  52.09 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  49.07 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  43.67 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  38.19 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  46.47 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  51.01 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  37.23 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  34.43 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  34.67 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.66 
 
 		 489 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  30.66 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 770 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 504 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.17 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 563 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 786 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 716 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 764 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  28.33 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 518 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.5 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.19 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.12 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  26.58 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.82 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.82 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.82 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.12 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.96 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.82 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.82 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.59 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.34 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.59 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  29.54 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 437 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 465 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 478 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.02 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.59 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 820 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  26.45 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.59 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 503 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 500 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>