More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12031 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  100 
 
 		 440 aa  833    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  68.86 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  72 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  72 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  72 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  71.82 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  72.28 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  67.4 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  60.15 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  59.34 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  60.85 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  59.2 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  63.05 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  67.58 
 
 		 411 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  52.27 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  59.28 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  53.98 
 
 		 420 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  55.64 
 
 		 418 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  53.24 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  50.95 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  43.91 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  36.72 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  36.94 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  36.72 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.47 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.6 
 
 		 489 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 745 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.78 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 466 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 770 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 482 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 504 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.65 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.65 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 518 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.71 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 764 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.6 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.39 
 
 		 446 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.94 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.94 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.23 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.02 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.56 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.83 
 
 		 753 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.34 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.02 
 
 		 725 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.72 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  27.65 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 820 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 792 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 465 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  27.7 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.67 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 538 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 463 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  30.57 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 494 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>