206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1681 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  100 
 
 		 427 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  43.65 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  41.02 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  41.21 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 418 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  43.24 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  36.22 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  36.95 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  36.43 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  41.4 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  37.28 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  33.89 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  27.17 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  27.87 
 
 		 437 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  34.59 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.6 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  28.92 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.66 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  24.36 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.32 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.32 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.32 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.54 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 716 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.65 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  22.47 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.41 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.41 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  21.9 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 458 aa  57  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 786 aa  56.6  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  29.08 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  27.99 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 520 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.17 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.17 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.12 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.17 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 467 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  21.7 
 
 		 792 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 475 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.05 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 725 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  22.88 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  21.19 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  21.75 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  22.43 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.17 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  22.65 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 491 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  21.51 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  20.6 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  22.67 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  30.93 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>