More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2418 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  100 
 
 
444 aa  863    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 
456 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 
764 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  31.48 
 
 
421 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 
770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.41 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3413  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
513 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.02 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  33.53 
 
 
503 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
466 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  31.65 
 
 
440 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  26.18 
 
 
467 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  28.79 
 
 
470 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  28.92 
 
 
422 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
740 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 
474 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 
439 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  29.82 
 
 
455 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 
449 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  28.21 
 
 
441 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 
716 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 
462 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
786 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.18 
 
 
753 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  24.6 
 
 
525 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 
538 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 
455 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
429 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
476 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 
485 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  26.08 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
529 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  28.02 
 
 
470 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  28.02 
 
 
470 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 
458 aa  97.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  26.98 
 
 
500 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  28.02 
 
 
470 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
468 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
520 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
468 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  30.41 
 
 
440 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  28.75 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.55 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  28.98 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 
820 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0506  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
460 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 
486 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 
486 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 
454 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  27.43 
 
 
437 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
504 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 
745 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  28.7 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
725 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
462 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
518 aa  93.2  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  27.32 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  30.07 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
466 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
408 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  29.81 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  27.98 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  30.52 
 
 
440 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  26.75 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  29.18 
 
 
467 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.38 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  27.27 
 
 
461 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 
495 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25 
 
 
449 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.16 
 
 
457 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 
506 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
476 aa  90.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.65 
 
 
452 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  28.57 
 
 
467 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  27.63 
 
 
480 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  29.54 
 
 
469 aa  89.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  27.93 
 
 
470 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 
433 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 
465 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.59 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 
488 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>