More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0569 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 415 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 415 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 415 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  72.13 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  74.02 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  66.75 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  72.17 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  62.5 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  60.73 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  67.99 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  57.52 
 
 		 423 aa  348  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  62.13 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 		 420 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  60.64 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  58.48 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  54.42 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  50.83 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  58.19 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.53 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  38.07 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  35.61 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  37.11 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.31 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.71 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.36 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.9 
 
 		 770 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  34.36 
 
 		 725 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  28.49 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  29.84 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 786 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.94 
 
 		 792 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.5 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.5 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 716 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 764 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 745 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 820 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.06 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.2 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.2 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.2 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.2 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  24.16 
 
 		 463 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  30.06 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  29.56 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 475 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  24.32 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 496 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 496 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 538 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.53 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 773 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  30.18 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 481 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.2 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>