More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0237 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 428 aa  792    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  86.06 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 421 aa  362  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  60.77 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  57.52 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  60.71 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  60.71 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  60.71 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  56.42 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  53.54 
 
 		 418 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  58.61 
 
 		 408 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  58.21 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  56.04 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  58.44 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  56.19 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  52.35 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  55.82 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  51.86 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  53.05 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.59 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  36.43 
 
 		 437 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  35.5 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  35.03 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.13 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 641 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.46 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.64 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  30.75 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 792 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.51 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 494 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 491 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.37 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.37 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 764 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.37 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.65 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.08 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.02 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.12 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.81 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.65 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 		 716 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.21 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.65 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.65 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.77 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.24 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2013  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0847443  normal  0.208384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.24 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.93 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>