More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0141 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 418 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  57.45 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  60.2 
 
 		 438 aa  328  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  54.01 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  51.44 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  52.84 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  55.66 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  54.85 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  57.55 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  57.55 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  57.55 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  54.88 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  57.45 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  55.53 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  57.07 
 
 		 411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  54.52 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  55.01 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  51.76 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  53.7 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  53.69 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  36.13 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  36.28 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  35.29 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  35.06 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  36.52 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.8 
 
 		 489 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.52 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.52 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 439 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.36 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 		 504 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.29 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.53 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.68 
 
 		 542 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2305  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 		 716 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 510 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.29 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.74 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  29.08 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.05 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 467 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.29 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.63 
 
 		 753 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.91 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 792 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.91 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 725 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.91 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.85 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 449 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  30.95 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  30.03 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  28.87 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  33.07 
 
 		 452 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  29.5 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 490 aa  93.6  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 491 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 488 aa  93.2  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  28.82 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 503 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.02 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 520 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.27 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  34.37 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 515 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>