More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2530 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 449 aa  891    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  29.26 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  30.48 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  29.17 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  30 
 
 		 431 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  25.53 
 
 		 753 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  27.87 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 716 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  28.36 
 
 		 438 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.65 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.4 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.4 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 510 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.87 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.61 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.61 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.61 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.61 
 
 		 445 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.38 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 549 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.35 
 
 		 483 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  22.53 
 
 		 786 aa  97.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 472 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 443 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  25.45 
 
 		 465 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 770 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.94 
 
 		 486 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.94 
 
 		 486 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 463 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.28 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.3 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  26.81 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.53 
 
 		 471 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.92 
 
 		 476 aa  93.2  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.74 
 
 		 466 aa  93.2  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 491 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  26.38 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  23.81 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2013  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0847443  normal  0.208384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.66 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  23.93 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.07 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 532 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.69 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.37 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>