More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6311 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  68.17 
 
 		 449 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  96.88 
 
 		 449 aa  865    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  100 
 
 		 449 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  52.22 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  47.2 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  48.22 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  48.65 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  49.44 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  41.97 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  45.79 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4918  amino acid permease-associated region  44.14 
 
 		 495 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  39.52 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  40.61 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  39.82 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  37.81 
 
 		 456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  37.67 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  37.67 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  42.09 
 
 		 448 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  37.67 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  38.95 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  37.13 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  37.44 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  37.44 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  36.82 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  39.41 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  38.23 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  36.67 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 450 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  36.07 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  35.75 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  35.97 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  35.75 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  35.75 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  36.85 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  35.75 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  35.75 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  35.75 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  37.05 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  35.75 
 
 		 461 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 459 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 455 aa  245  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  34 
 
 		 456 aa  246  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  32.89 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  37.53 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  37.3 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  34.37 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  34.53 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  34.7 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  32.59 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  33.18 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  32.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  32.37 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  32.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  32.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  32.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  32.57 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  32.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  32.37 
 
 		 463 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  32.1 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  33.56 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>