More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6300 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  98.73 
 
 		 473 aa  924    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 473 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 473 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  42.99 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  41.74 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  41.51 
 
 		 449 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  41.69 
 
 		 468 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  39.82 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  40.8 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  35.31 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  36.79 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  37.03 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  36.79 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  35.46 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  36.56 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  36.32 
 
 		 447 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  36.12 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  36.79 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  31.57 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  31.22 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4918  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  32.71 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  30.79 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  31.53 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  35.49 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  35.49 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  31.15 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  35.49 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  33.25 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  32.18 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  31.32 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  33.63 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  31.67 
 
 		 456 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  30.51 
 
 		 461 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  30.43 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  30.66 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  30.43 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  30.43 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  30.66 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  32.51 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  30.66 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  32.9 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  34.55 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  31.93 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 		 464 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  32.2 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  32.2 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  32.2 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  32.2 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  32.2 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  29.89 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  30.34 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  29.89 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  32.07 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  31.75 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  31.36 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  31.8 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  31.71 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  31.05 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  32.56 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  29.18 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 443 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>