More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  91.92 
 
 		 443 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  100 
 
 		 434 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  59.72 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  59.72 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  59.72 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  59.49 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  51.95 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  50.92 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  51.62 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  50.58 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  50.35 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  49.08 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  45.85 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  42.86 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  41.24 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  42.86 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  44.47 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  44.79 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  43.52 
 
 		 443 aa  359  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  42.82 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  42.82 
 
 		 443 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 		 456 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  42.82 
 
 		 443 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  42.49 
 
 		 443 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  42.69 
 
 		 450 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  42.69 
 
 		 450 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  42.69 
 
 		 450 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  41.3 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  41.3 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  41.3 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  41.3 
 
 		 461 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  41.07 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  41.07 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  41.07 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  41.07 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  40.27 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  41.71 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  39.73 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  41.11 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 453 aa  319  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  38.94 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  38.94 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  38.94 
 
 		 463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  37.99 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  37.99 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  37.99 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  37.99 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  37.99 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  37.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  40.28 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  40.28 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  40.28 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  38.94 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  38.62 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  39.3 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  39.17 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  38.98 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  38.11 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  38.11 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  35.14 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  36.85 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  36.38 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 449 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  35.63 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  33.79 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  31.53 
 
 		 466 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  30.49 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  35.21 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  33.26 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  33.03 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  33.03 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  32.81 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  31.54 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  32.58 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  32.1 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>