More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1879 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 421 aa  789    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  68.72 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  66.99 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  66.99 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  66.99 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  55.05 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  64.11 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  61.5 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  60.25 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  56.48 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  61.31 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  57.21 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  55.74 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  57.49 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  49.76 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  58.74 
 
 		 407 aa  302  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  51.81 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  55.23 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  51.67 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  49.05 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  33.01 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  34.89 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.84 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  33.18 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  32.61 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  32.71 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.88 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.99 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  31.79 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 770 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 792 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  29.61 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  29.61 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 764 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 486 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 725 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 716 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.09 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  26.92 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.89 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.66 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.66 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.83 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 504 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 786 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 745 aa  116  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.63 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.92 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 473 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 820 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 539 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 538 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  28.7 
 
 		 463 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.53 
 
 		 753 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.83 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>