More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1710 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  100 
 
 
418 aa  827    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  74.57 
 
 
412 aa  557  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  47.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  47.56 
 
 
394 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  43.13 
 
 
411 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  40.26 
 
 
413 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 
439 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  38.74 
 
 
425 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  37.57 
 
 
436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 
475 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
452 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  35.82 
 
 
452 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 
437 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  32.68 
 
 
422 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  32.75 
 
 
446 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  33.91 
 
 
454 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 
446 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 
474 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 
483 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 
483 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
451 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
451 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  34.13 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  34.89 
 
 
506 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  32.85 
 
 
461 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 
472 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 
438 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  37.08 
 
 
433 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  34.79 
 
 
473 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  32.81 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  34.99 
 
 
479 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  34.83 
 
 
461 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 
487 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 
470 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 
470 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 
472 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 
493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  33.81 
 
 
478 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  33.25 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  32.69 
 
 
439 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 
486 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 
449 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 
491 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 
491 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 
494 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.35 
 
 
489 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.99 
 
 
471 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 
476 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.52 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.52 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.52 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.52 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.52 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.54 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
566 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.5 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.93 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  27 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.05 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 
482 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 
482 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 
538 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
471 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
471 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.34 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.47 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.47 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.47 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.61 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.75 
 
 
467 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  28.3 
 
 
471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  28.78 
 
 
471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
491 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  28.3 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.78 
 
 
471 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.29 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.29 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.29 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.98 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.3 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
549 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.24 
 
 
466 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 
441 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.34 
 
 
476 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>