More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1612 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 452 aa  865    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  75.62 
 
 		 455 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  60.05 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  58.41 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  59.2 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  58.16 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  55.9 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  58.51 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  57.24 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  50.79 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  53.17 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  49.34 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  52.39 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  51.68 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  51.45 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  51.45 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  53.97 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  49.11 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  47.66 
 
 		 461 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  47.64 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  46.98 
 
 		 502 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  49.88 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  47.63 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  48.81 
 
 		 487 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  48.25 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  46.62 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  48.64 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  48.64 
 
 		 451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  48.64 
 
 		 451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  51.51 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 478 aa  332  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  47.86 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  50.46 
 
 		 449 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  51.65 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  35.82 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  37.19 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  33.42 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  34.16 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  33.82 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  31.96 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  30.93 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.94 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.84 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 		 770 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.95 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.9 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 496 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 496 aa  120  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  30.41 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  29.03 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.27 
 
 		 476 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.25 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 465 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.08 
 
 		 497 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>