More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1826 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 436 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  45.28 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  47.02 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  37.12 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  37.03 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  39.9 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  41.32 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  36.12 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  36.41 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  34.95 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 486 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  38.58 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  31.32 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  32.34 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 486 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  37.17 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  36.84 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 494 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 		 466 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 		 466 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  37 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  31.52 
 
 		 495 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  32.51 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  33.93 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  33.56 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  33.56 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  35.93 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  30.39 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  31.73 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  31.45 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 471 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 506 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  30.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  30.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  30.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  30.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  30.09 
 
 		 471 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  30.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.09 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 		 493 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  29.25 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 		 475 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  31.42 
 
 		 495 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  37.43 
 
 		 461 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  32.3 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  35.83 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.92 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  34.25 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  35.83 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  32.3 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.7 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.7 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.93 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  33.26 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.7 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  32.08 
 
 		 471 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  33.08 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.48 
 
 		 471 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  31.86 
 
 		 471 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  32.54 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  36.14 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.7 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.7 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  34.61 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  31.89 
 
 		 471 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  31.89 
 
 		 471 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  31.79 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  31.79 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>