More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2108 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 445 aa  883    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  75.58 
 
 		 451 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  59.55 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  58.64 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  53.47 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  52.55 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  52.55 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  54.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 452 aa  329  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  44.36 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  44.36 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  42.43 
 
 		 420 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  28.04 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  28.04 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  30.55 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  27.99 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.3 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 770 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  27.64 
 
 		 279 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.59 
 
 		 422 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 786 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  24.78 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  25.23 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 745 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  26.52 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 716 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  25.94 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 820 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  25.3 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.41 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.61 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  22.97 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.26 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.26 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.62 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  26.34 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  24.29 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.44 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.16 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  25.45 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1457  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  26.83 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  28.39 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  24.16 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  28.33 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.83 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.6 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  28.7 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.33 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>