More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1315 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 441 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  45.58 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  47.39 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  35.92 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  35.92 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  33.77 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  37.13 
 
 		 279 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  28.86 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  30.08 
 
 		 753 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 770 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 764 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 773 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.96 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.96 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.96 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.96 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  32.51 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  26.61 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.96 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.96 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.71 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.46 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  26.32 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.34 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 740 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.13 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.13 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 716 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 792 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 725 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  28.89 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 452 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 		 820 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 745 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 491 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.3 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 538 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 518 aa  90.1  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 467 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  27.86 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.65 
 
 		 467 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.65 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 812 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 500 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 462 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.11 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.11 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.11 
 
 		 467 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.47 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>