More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0803 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  100 
 
 
429 aa  839    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  61.59 
 
 
447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  40.05 
 
 
434 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  34.59 
 
 
433 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 
441 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 
434 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  43.75 
 
 
279 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
430 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 
430 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  28.74 
 
 
430 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  28.74 
 
 
430 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  30.13 
 
 
430 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  30.13 
 
 
430 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  30.13 
 
 
430 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  28.74 
 
 
430 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  29.87 
 
 
430 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
452 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 
440 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  31.2 
 
 
437 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 
431 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 
786 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 
770 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
450 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
450 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 
764 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
486 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 
745 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 
716 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
467 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.59 
 
 
467 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.52 
 
 
467 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.52 
 
 
467 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.52 
 
 
467 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.52 
 
 
467 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.52 
 
 
467 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.52 
 
 
467 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
467 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.13 
 
 
467 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
773 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  27.42 
 
 
413 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  29.43 
 
 
426 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
494 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  28.62 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 
488 aa  99  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
476 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 
820 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
510 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  28.62 
 
 
474 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 
518 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 
506 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
464 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.21 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.21 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
481 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
538 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
740 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
500 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.78 
 
 
471 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.78 
 
 
471 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
796 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.18 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 
455 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 
471 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 
481 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.18 
 
 
463 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.1 
 
 
460 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  23.78 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.88 
 
 
753 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.4 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.32 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.32 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 
488 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 
476 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.07 
 
 
440 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  28.05 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.75 
 
 
471 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
471 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.75 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.75 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>