More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1272 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 431 aa  843    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0681  amino acid permease-associated region  76.92 
 
 		 195 aa  272  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  30.25 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  30.35 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  27.48 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  27.48 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  28.93 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  27.87 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 452 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  28.42 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  27.44 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 445 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 445 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 770 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 764 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  28.45 
 
 		 279 aa  99.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 745 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 506 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 494 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 420 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  25.55 
 
 		 753 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.29 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  26.03 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  25.67 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  24.81 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 796 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 820 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 725 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.81 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.19 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.44 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.44 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.44 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.44 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.44 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  21.94 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  22.7 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.87 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.71 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.71 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.99 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.59 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  21.74 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  26.93 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  23.38 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.33 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.94 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  23.97 
 
 		 476 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>