More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2694 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 450 aa  881    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  99.76 
 
 		 420 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 450 aa  881    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  67.59 
 
 		 452 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  48.77 
 
 		 441 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  48.37 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  49.88 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  49.88 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 451 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  46.14 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  44.36 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  29.13 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  28.93 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  28.93 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  28.93 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  28.93 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  30.17 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  30.17 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  29.82 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  29.92 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  28.93 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 770 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  31.84 
 
 		 279 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.76 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 520 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.39 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 745 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 786 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  26.16 
 
 		 461 aa  90.5  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 474 aa  89.7  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.8 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 820 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  26.18 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.45 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  30.12 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.3 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.14 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.22 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.22 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.78 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.78 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.78 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 796 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 740 aa  77  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  23.68 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.28 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  22.94 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  22.73 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  25.21 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  29.12 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  22.51 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  25.2 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  22.51 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  22.84 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  23.35 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24.31 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>