More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5386 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  100 
 
 
483 aa  951    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  73.94 
 
 
483 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  71.49 
 
 
479 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  72.83 
 
 
470 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  72.83 
 
 
470 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  72.61 
 
 
470 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  71.15 
 
 
478 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  63.06 
 
 
493 aa  538  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  65.28 
 
 
474 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  62.55 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  64.89 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  58.78 
 
 
502 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  64.25 
 
 
473 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  60.13 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  55.58 
 
 
472 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  54.42 
 
 
454 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  55.46 
 
 
472 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  53.95 
 
 
446 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  55.27 
 
 
461 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  50.9 
 
 
452 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  51.9 
 
 
455 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  48.51 
 
 
475 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  49.17 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  44.68 
 
 
506 aa  297  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  43.19 
 
 
452 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  40.81 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 
438 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  41.33 
 
 
451 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  41.25 
 
 
451 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  41.25 
 
 
451 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  42.09 
 
 
439 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 
451 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  46.19 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  43.59 
 
 
454 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 
449 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 
436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 
439 aa  208  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 
418 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  33.25 
 
 
422 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  35.17 
 
 
394 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  33.43 
 
 
394 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  31.88 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  31.95 
 
 
412 aa  156  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  31.54 
 
 
425 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  30.62 
 
 
413 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.58 
 
 
471 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.58 
 
 
471 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  33.66 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.64 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  30.27 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 
476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
468 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
466 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
466 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
468 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.34 
 
 
468 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 
468 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
486 aa  121  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
466 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 
463 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 
501 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.31 
 
 
489 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 
515 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
786 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.12 
 
 
486 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.12 
 
 
486 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 
745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.45 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 
549 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 
465 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 
770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
467 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 
465 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 
495 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.08 
 
 
471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  29.4 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26 
 
 
494 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 
764 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
500 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
494 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
481 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
491 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 
468 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.22 
 
 
483 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
495 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
538 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 
481 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
478 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 
503 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 
469 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>