More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3650 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  100 
 
 		 413 aa  796    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  78.05 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  39.36 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  37.94 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  39.3 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  41.28 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  39.57 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  34.61 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  35.15 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  30.96 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  30.03 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  33.08 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  35 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  30.99 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  34.04 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 446 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  30.5 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  30.88 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 487 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  31.33 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  31.11 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  34.18 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 		 474 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  32.6 
 
 		 438 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  28.09 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  30.66 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 470 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 491 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  30.27 
 
 		 468 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  29.63 
 
 		 463 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.44 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.44 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.22 
 
 		 489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.37 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  30.77 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  30.54 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  29.4 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 449 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  29.93 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.79 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.79 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.1 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  30.02 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.27 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.12 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.12 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.12 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.12 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>