More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3911 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  100 
 
 
452 aa  890    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  60.88 
 
 
467 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  52.19 
 
 
452 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  45.76 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 
482 aa  292  9e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  36.82 
 
 
452 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
461 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 
469 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
499 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.35 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  30.53 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  31.79 
 
 
580 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  35.24 
 
 
439 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  32.49 
 
 
490 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.98 
 
 
445 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  31.39 
 
 
473 aa  190  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  27.95 
 
 
522 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  27.47 
 
 
609 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 
444 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 
484 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 
474 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
443 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  34.33 
 
 
495 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  29.48 
 
 
458 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  30.42 
 
 
440 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
447 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
472 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 
440 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 
440 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.03 
 
 
452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.91 
 
 
443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.45 
 
 
438 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 
453 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.23 
 
 
438 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.23 
 
 
438 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
439 aa  133  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.23 
 
 
438 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25 
 
 
437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 
435 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 
463 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
770 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.27 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.04 
 
 
462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.04 
 
 
462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.04 
 
 
445 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
445 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.04 
 
 
445 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.04 
 
 
445 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.04 
 
 
445 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
764 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 
494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 
786 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.35 
 
 
480 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
441 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
436 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 
503 aa  106  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.49 
 
 
753 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.43 
 
 
440 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.89 
 
 
471 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.89 
 
 
471 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.89 
 
 
471 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.89 
 
 
471 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.89 
 
 
471 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 
457 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.65 
 
 
471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
485 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.35 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
427 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.65 
 
 
471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  27.22 
 
 
422 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 
465 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
468 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  24.17 
 
 
507 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 
792 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.12 
 
 
463 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.12 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  28.53 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.17 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
488 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 
474 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 
473 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
538 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.49 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.49 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 
468 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.49 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
745 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>