More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00442 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  100 
 
 
430 aa  842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  842    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  99.53 
 
 
430 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  99.53 
 
 
430 aa  840    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  99.53 
 
 
430 aa  840    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  100 
 
 
430 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  98.84 
 
 
430 aa  832    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  99.3 
 
 
430 aa  838    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  99.53 
 
 
430 aa  839    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 
434 aa  203  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 
447 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  35.73 
 
 
433 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 
441 aa  186  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
441 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 
440 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  30.31 
 
 
429 aa  156  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  27.97 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  35.32 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
443 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
452 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
450 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
450 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 
770 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 
425 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 
420 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
786 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
473 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
474 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 
745 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.16 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  27 
 
 
792 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 
773 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
764 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  27 
 
 
483 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.16 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.92 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.92 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.92 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.92 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.92 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.16 
 
 
471 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 
510 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.74 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.74 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
490 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  27.32 
 
 
460 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 
467 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 
506 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
725 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  22.52 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.35 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  26.38 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.22 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.22 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.22 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.94 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.97 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  25.51 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 
764 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.67 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.67 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.33 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.96 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.27 
 
 
753 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  21.72 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  21.86 
 
 
538 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  29.37 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.39 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  25.25 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.39 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>