More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0129 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 451 aa  904    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  75.58 
 
 		 445 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  57.97 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  53.23 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  52.94 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  51.79 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  51.79 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  43.17 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  27.11 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  27.29 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  27.29 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  27.29 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  28.01 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  28.01 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  27.06 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  27.27 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  26.62 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  27.85 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 474 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 436 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.59 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 786 aa  90.1  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 770 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.56 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.59 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.54 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.81 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.81 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.81 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.16 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.52 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 745 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  25.72 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 716 aa  81.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.8 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  25.81 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  25.65 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  27.92 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  23.24 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  27.21 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.64 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  24.42 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1457  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  24.42 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.31 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.73 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.49 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  27.06 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.49 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  23.91 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>