More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  100 
 
 		 461 aa  903    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  63.38 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  64.32 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  57.91 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  56.33 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  54.5 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  55.73 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  53.93 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  54.61 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  56.38 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  53.94 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  53.93 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  53.72 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  53.72 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  51.02 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  55.04 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  53.51 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  52.28 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  52.87 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  51.84 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  49.55 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  49.13 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  50.74 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  49.4 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  46.93 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  43.19 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  45.87 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  44.72 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  46.58 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  44.71 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  46 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  45.08 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  34.67 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  33.01 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  34.82 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  34.54 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  33.25 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  30.51 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  30.34 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  30.24 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.65 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.9 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.7 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.7 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.9 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 495 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 491 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  25.35 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.41 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.41 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  24.66 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.45 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.45 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.85 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 786 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 501 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.82 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.49 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  27.08 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 539 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 494 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>