More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12010 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12010  permease  100 
 
 		 481 aa  946    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  38.73 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  36.74 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  34.54 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  31.87 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 451 aa  133  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  27.7 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  29.5 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 433 aa  99.8  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.26 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  27.13 
 
 		 437 aa  90.1  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.74 
 
 		 542 aa  87.4  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.77 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.77 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.77 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 491 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.96 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.54 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.59 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.59 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.35 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.23 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.49 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.8 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.54 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.49 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.21 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1733  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.15 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.4 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.4 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.4 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.4 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.39 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.4 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.96 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.59 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.28 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.35 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  25.91 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.84 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  25.92 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  22.95 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  30.39 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.58 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  24.41 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.81 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  24.03 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  23.64 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  26.24 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.81 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  23.6 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.29 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.96 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  23.6 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  23.6 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  23.6 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.57 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.5 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>