More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0867 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  73.02 
 
 		 451 aa  671    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  100 
 
 		 450 aa  900    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  76.7 
 
 		 466 aa  708    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  35.12 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  34.68 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  27.69 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  27.48 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.58 
 
 		 471 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.87 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  25.16 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.45 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  28.37 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  26.26 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.97 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.53 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.58 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.58 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.81 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.3 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.53 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.68 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.31 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.91 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  23.87 
 
 		 471 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  23.49 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.09 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  26.58 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.72 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  25.7 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.2 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.09 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 466 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 503 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 516 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  23.04 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.22 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.2 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.04 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.2 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 503 aa  90.9  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 473 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 473 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  24.32 
 
 		 473 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  21.88 
 
 		 494 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  25 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  24.09 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.65 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.9 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  23.14 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  24.41 
 
 		 478 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  24.1 
 
 		 473 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.03 
 
 		 463 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.14 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.14 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  24.78 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  22.49 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  21.6 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  24.25 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  24.14 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>