More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2346 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 447 aa  890    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  92.92 
 
 		 452 aa  827    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  39.68 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  38.98 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  38.93 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 		 445 aa  265  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  39.71 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  38.64 
 
 		 460 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  37.59 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  34.48 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  33.26 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  30.59 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  33.18 
 
 		 438 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  30.32 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  30.32 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  30.32 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  30.32 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  30.09 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  30.3 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  29.47 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  29.47 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  29.47 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  29.77 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  32.84 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 503 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  30.62 
 
 		 508 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  30.38 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  30.62 
 
 		 509 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  30.38 
 
 		 510 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  29.9 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 474 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  30.15 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  29.58 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  30.56 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  28.85 
 
 		 436 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  29.34 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 750 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  30.39 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  30.39 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  28.5 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  30.39 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  29.26 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  29.1 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  30.39 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  28.64 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  30.15 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  28.85 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  28.47 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  28.05 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  30.15 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  28.47 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  27.86 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  28.61 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  28.61 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  28.81 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  30.81 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  29.17 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  27.88 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  28.99 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  26.36 
 
 		 475 aa  154  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2500  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  27.53 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  26.88 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  27.53 
 
 		 465 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  27.65 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  27.07 
 
 		 480 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  28.17 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  27.31 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  27.31 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  27.31 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  27.1 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  27.27 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  26.83 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  27.05 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  27.43 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  27.05 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  26.67 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  26.83 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  27.71 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  25.53 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  25.32 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  27 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  25.32 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>