More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2719 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  100 
 
 
427 aa  833    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  63.85 
 
 
426 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 
451 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 
466 aa  237  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  35.13 
 
 
450 aa  237  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 
429 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  33.33 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 
433 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  32.54 
 
 
464 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  32.61 
 
 
466 aa  166  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  32.03 
 
 
481 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  30.36 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  30.36 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  30.36 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  27.21 
 
 
435 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  30.65 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  29.75 
 
 
471 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.83 
 
 
471 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  29.98 
 
 
471 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  31.61 
 
 
437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  30.2 
 
 
471 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.02 
 
 
471 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  29.31 
 
 
471 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 
471 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  28.02 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
476 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.56 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.79 
 
 
471 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.33 
 
 
471 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.88 
 
 
471 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.88 
 
 
471 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.88 
 
 
471 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.88 
 
 
471 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.88 
 
 
471 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.52 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.52 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.74 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.74 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.39 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.39 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.39 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.39 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  27.52 
 
 
437 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
476 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  26.85 
 
 
445 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  29.9 
 
 
450 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  26.39 
 
 
445 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.74 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.38 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.74 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.06 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.77 
 
 
467 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.77 
 
 
467 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  25.98 
 
 
509 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.83 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  25.69 
 
 
508 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.77 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.77 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.8 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.77 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.77 
 
 
467 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
467 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  25.69 
 
 
508 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.28 
 
 
476 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  28.19 
 
 
444 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  28.19 
 
 
444 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  25 
 
 
510 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
467 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 
476 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.71 
 
 
483 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
448 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  27.93 
 
 
444 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.43 
 
 
462 aa  123  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  26.97 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
491 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.95 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
453 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 
465 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.62 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>