More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2801 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  100 
 
 		 476 aa  935    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  36.72 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  39.12 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  38.71 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  39.31 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  36.15 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  36.24 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  36.24 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  36.24 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  36.24 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  36 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  35.95 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  37.41 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  34.85 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  33.49 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  33.49 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  33.49 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  34.65 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  30.86 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  32.96 
 
 		 508 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  32.96 
 
 		 508 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  32.96 
 
 		 509 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  33.11 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  33.49 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  35.27 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  31.92 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  33.49 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  30.26 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  29.82 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.04 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.04 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  30.04 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  30.04 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  30.04 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  29.61 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  29.82 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  29.08 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  30.23 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  31.4 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  31.76 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  28.51 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  31.76 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  29.67 
 
 		 452 aa  173  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  29.77 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  34.05 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  29.77 
 
 		 439 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  29.77 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  28.83 
 
 		 478 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  28.83 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  30.8 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  32.98 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  29.57 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  29.57 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  30.8 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  29.77 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  29.53 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  29.57 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  29.57 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  29.3 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  29.28 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  29.88 
 
 		 439 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  30.93 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  30.93 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  30.93 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  30.93 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  30.93 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  29.93 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 750 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  27.86 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  30.25 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  28.77 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  29.41 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  29.41 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  29.41 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  29.41 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  29.53 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  29.64 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  30.64 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  30.47 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  29.21 
 
 		 471 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  29.21 
 
 		 471 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  29.37 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  27.65 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>