More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1651 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 466 aa  931    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  71.4 
 
 		 451 aa  684    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  76.7 
 
 		 450 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 427 aa  237  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  33.72 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  33.26 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  27.17 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  25.4 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  25.49 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.36 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  27.92 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  26.85 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.9 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.35 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.35 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.55 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.77 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.52 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.35 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.38 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.69 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.1 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.36 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 516 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.48 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.58 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.1 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.95 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.95 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.74 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.74 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.74 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.74 
 
 		 467 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.95 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.31 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  26.51 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.16 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  27.14 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  28.19 
 
 		 421 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  24.24 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.52 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.11 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.78 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.87 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 566 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  23.74 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 503 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.22 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.64 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.22 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.22 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  21.86 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  22.71 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  21.98 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  21.98 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.15 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  21.98 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.4 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  21.98 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>