More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00777 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  100 
 
 		 435 aa  860    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  30.75 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  28.73 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  30.41 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  29.59 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.86 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  30.35 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  27.87 
 
 		 411 aa  99  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.41 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  30.2 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  25.11 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  25.11 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  25.11 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  25.11 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  24.89 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  24.89 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  24.89 
 
 		 444 aa  96.3  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  25.28 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  28.72 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  24.66 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  24.66 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 443 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  31.2 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  30.77 
 
 		 510 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  28.03 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  31.2 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  31.2 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  24.43 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  28.62 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  28 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  23.47 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.77 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.94 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  21.48 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  32.46 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  32.6 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  32.6 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  32.6 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  32.6 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  32.6 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.93 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  22.36 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  26.89 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  27.43 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  30.84 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  31.76 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.98 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  32.16 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  24.08 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  24.62 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  29.96 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  23.65 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  24.13 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  23.69 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  25.26 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  24.94 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  25.31 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  24.84 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 750 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>