More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2522 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  100 
 
 
461 aa  905    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  37.41 
 
 
489 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 
495 aa  209  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 
507 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 
502 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 
511 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 
502 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 
492 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 
492 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 
492 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 
490 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 
501 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 
506 aa  150  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
491 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 
497 aa  136  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
477 aa  136  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
510 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
510 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
510 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
482 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 
513 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
486 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
521 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 
450 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  26.95 
 
 
497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
495 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 
466 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 
466 aa  113  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.21 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 
483 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
450 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
450 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 
454 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.16 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.16 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
484 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 
476 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 
440 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  27.35 
 
 
450 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 
450 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.6 
 
 
471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.6 
 
 
471 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.49 
 
 
456 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 
462 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.27 
 
 
456 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 
455 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
464 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
466 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
440 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  26.76 
 
 
443 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.89 
 
 
489 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 
469 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 
456 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
487 aa  104  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.19 
 
 
467 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 
465 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
443 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.81 
 
 
443 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
467 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
454 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
443 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 
443 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
443 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.09 
 
 
467 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 
441 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.09 
 
 
467 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.89 
 
 
467 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
468 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 
491 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25 
 
 
476 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
443 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 
506 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  27.03 
 
 
468 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 
471 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
443 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 
506 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 
449 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
443 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  29.5 
 
 
463 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
462 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
462 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
462 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.68 
 
 
449 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.09 
 
 
467 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 
463 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>