More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3299 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 491 aa  961    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  73.18 
 
 		 486 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  65.57 
 
 		 521 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 477 aa  287  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 501 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  26.1 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 513 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 526 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 516 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 510 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 507 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  25.99 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 502 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.22 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  26.3 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.42 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  24.2 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.05 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.05 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  26.56 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.05 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  22.9 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.65 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  27.01 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.91 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.65 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>