More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1170 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  100 
 
 		 497 aa  965    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  78.84 
 
 		 484 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  48.01 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  43.74 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  40.93 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  39.22 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  40.74 
 
 		 490 aa  299  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 		 485 aa  297  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  47.62 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.18 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  39.84 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  42.51 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  38.59 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  39.03 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 491 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  38.91 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 504 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 496 aa  266  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  34.83 
 
 		 510 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  40.94 
 
 		 483 aa  251  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  35.03 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  37.16 
 
 		 502 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  32.07 
 
 		 481 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  35.35 
 
 		 504 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.94 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.28 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 511 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.27 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.38 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.38 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.38 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.38 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.42 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 459 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 464 aa  90.1  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.49 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.25 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 475 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 521 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.6 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  28.77 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  22.4 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  21.87 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.73 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.35 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  21.87 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.07 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>