More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7499 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 495 aa  964    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  46.56 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  46.56 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  44.28 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  40.83 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  40.83 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  45.37 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  40.96 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  43.74 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  41.47 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  35.38 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  42.7 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  40.81 
 
 		 504 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  40.73 
 
 		 496 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  40.79 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 485 aa  249  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  38.41 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 		 507 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  35.46 
 
 		 486 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 513 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  33.33 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  34.94 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 521 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.49 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 511 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 501 aa  90.9  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  28.22 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 449 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 449 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.68 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  28.61 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.48 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  29.03 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  31.03 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  29.63 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  27.4 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  23.28 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.68 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  27.12 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  27.12 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  26.63 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>