More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1999 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 490 aa  969    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  39.75 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  38.03 
 
 		 497 aa  325  9e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  40.82 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  28.3 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2850  amino acid permease-associated region  53.12 
 
 		 134 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 516 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 491 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 450 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 477 aa  103  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 439 aa  97.8  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 507 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 475 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  22.38 
 
 		 489 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 527 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 503 aa  87  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  27.93 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.2 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.2 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.74 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.58 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  25.7 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  20.86 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  24.25 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.27 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.31 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  24 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  22.89 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  22.71 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.52 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.27 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>