More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2831 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  64.27 
 
 		 501 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 497 aa  983    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  68.58 
 
 		 506 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  37.82 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2850  amino acid permease-associated region  65.57 
 
 		 134 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  26.97 
 
 		 468 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  28.49 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 469 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 516 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 479 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 479 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.46 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 495 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.9 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.19 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 485 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.9 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  24.09 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  24.09 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  24.09 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  24.09 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  24.09 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  28.46 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  22.14 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  23.81 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  21.99 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  27.18 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  27.6 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>