More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1984 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 468 aa  900    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  75.74 
 
 		 474 aa  709    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  21.36 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  22.33 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.56 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  21.95 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43398  APC family transporter: amino acid  35.86 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  21.58 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0924  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  21.65 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  26.46 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  26.46 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.61 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 561 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  28.45 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  31.55 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  29.11 
 
 		 528 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  29.11 
 
 		 528 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.96 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  26.79 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  26.79 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.01 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  28.09 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.12 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0552  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  28.02 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.29 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  29.7 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 490 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  28.92 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  24.26 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  28.31 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  31.33 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 745 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.11 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  24.94 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  26.46 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>