More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3239 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 464 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  79.43 
 
 		 467 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  44.32 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  44.32 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  45.7 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 		 516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  38.29 
 
 		 497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  37.39 
 
 		 509 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 510 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 		 510 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 		 510 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  34.91 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  37.84 
 
 		 486 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  37.21 
 
 		 488 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  40.61 
 
 		 497 aa  259  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  34.41 
 
 		 490 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  36.57 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  34.92 
 
 		 510 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  38.12 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  34.01 
 
 		 474 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  35.09 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  34.37 
 
 		 493 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  36.22 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  32.83 
 
 		 502 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  30.71 
 
 		 527 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  30.44 
 
 		 504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 511 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 502 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  24.34 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.99 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  27.13 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.03 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  25.78 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.63 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.12 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  27.79 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  29.19 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  27.3 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  29.38 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>